Διοικητικά όργανα του Συλλόγου είναι:
α) η Γενική Συνέλευση
β) το Διοικητικό Συμβούλιο
γ) η Εξελεγκτική Επιτροπή
δ) το Επιστημονικό Συμβούλιο
Σε σώμα συνήλθε την Δευτέρα 4 Μαρτίου 2019 το Διοικητικό Συμβούλιο του Συλλόγου «Αγάπη» μετά τις αρχαιρεσίες που πραγματοποιήθηκαν την ίδια ημέρα.
Πρόεδρος: Ο Μητροπολίτης Ρεθύμνης και Αυλοποτάμου Κος Ευγένιος
Αντιπρόεδρος: ο Ιερέας Γεώργιος Γαλεράκης
Γενική Γραμματέας: η κα Βασιλική Γαβαλά
Ταμίας: ο κος Γρηγόριος Τσιομπίκας
Ως μέλη του διοικητικού συμβουλίου εξελέγησαν:
οι κυρίες Μαρία Αγριμάκη και Ιωάννα Χρυσού και ο κύριος Κωσταντίνος Παλιεράκης.
Εκπρόσωπος της Π.Ε. Ρεθύμνης η κα Μαρία Καββάλου
Εκπρόσωπος του Δήμου Ρεθύμνης η κα Ειρήνη Κουτσαλεδάκη.
Το νέο διοικητικό συμβούλιο θα έχει τετραετή θητεία.
Σε σώμα συνήλθε την Δευτέρα 6 Απριλίου 2015 το διοικητικό συμβούλιο του Συλλόγου «ΑΓΑΠΗ» μετά τις αρχαιρεσίες που πραγματοποιήθηκαν την Δευτέρα 30 Μαρτίου 2015.
Πρόεδρος: Μητροπολίτης Ρεθύμνης και Αυλοποτάμου Κος Ευγένιος.
Αντιπρόεδρος: ο Ιερέας Νικόλαος Νικηφόρος
Γενική Γραμματέας: η κα Ελένη Μοσχονά
Ταμίας: η κα Μαρία Δοκιμάκη-Παλαφούτη
Ως μέλη του διοικητικού συμβουλίου εξελέγησαν οι κυρίες:
Ζωή Φραγιαδάκη, Αγοραστή Μόραλη-Τσουδερού και Ιωάννα Χρυσού.
Εκπρόσωπος της ΠΕ Ρεθύμνης η κα Καλλιόπη Κλάδου-Δουλουμπέκη
Eκπρόσωπος του Δήμου Ρεθύμνης ο κος Γρηγόρης Τσιομπίκας.
Το νέο διοικητικό συμβούλιο του Συλλόγου, το οποίο είναι εννεαμελές θα έχει τετραετή θητεία.